Инд. авторы:	Воропаева О.Ф., Гаврилова К.С., Сенотрусова С.Д.
Заглавие:	Математическое моделирование динамики сети биомаркеров дегенеративных заболеваний
Библ. ссылка:	Воропаева О.Ф., Гаврилова К.С., Сенотрусова С.Д. Математическое моделирование динамики сети биомаркеров дегенеративных заболеваний // Распределенные информационно-вычислительные ресурсы. Цифровые двойники и большие данные (DICR-2019): Труды XVII Международной конференции (Новосибирск, 03.12-06.12.2019) / Под ред. О.Л. Жижимова, А.В. Юрченко. - 2019. - Новосибирск: ИВТ СО РАН. - С.185-190. - ISBN: 978-5-905569-14-2. - http://elib.ict.nsc.ru/jspui/bitstream/ICT/4694/33/DICR-2019-V3_p185-190.pdf
Внешние системы:	DOI: 10.25743/ICT.2019.15.81.028; РИНЦ: 41580534;
Реферат:	rus: Выполнен сопоставительный анализ ряда известных математических моделей функционирования сигнального пути белка p53, основанных на разных биологических идеализациях процесса. Даны оценки области применимости моделей. Обнаружены бифуркации Андронова-Хопфа и Неймарка-Сакера в диапазонах фазовых состояний p53 и его ингибиторов, соответствующих нормальной реакции сигнального пути p53 на стресс. Исследованы варианты гипотетических терапевтических противораковых стратегий. eng: A comparative analysis of a number of known mathematical models of the p53 protein signaling pathway functioning based on different biological idealizations of the process is performed. Es-timates of the applicability of the models are given. Andronov-Hopf and Neimark–Saker bifur-cations were found in the ranges of p53 phase states and its inhibitors corresponding to the nor-mal response of the p53 signaling pathway to stress. Variants of hypothetical therapeutic anti-cancer strategies were investigated.
Ключевые слова:	tumor marker; quasiperiodic oscillations; bifurcations; delay equation; mathematical modeling; p53; онкомаркер; квазипериодические колебания; бифуркации; уравнение с запаздыванием; математическое моделирование; микроРНК; microRNA;
Издано:	2019
Физ. характеристика:	с.185-190
Ссылка:	http://elib.ict.nsc.ru/jspui/bitstream/ICT/4694/33/DICR-2019-V3_p185-190.pdf
Конференция:	Название: XVII Международная конференция «Распределенные информационно-вычислительные ресурсы: Цифровые двойники и большие данные» Аббревиатура: DICR-2019 Город: Новосибирск Страна: Россия Даты проведения: 2019-12-03 - 2019-12-06 Ссылка: http://conf.ict.nsc.ru/dicr2019
Цитирование:	[1] Batchelor E., Mock C.S., Bhan I., Loewer A., Lahav G. Recurrent initiation: A mechanism for triggering p53 pulses in response to DNA damage // Molecular Cell. 2008. V. 30, № 3. P. 277-289. [2] Purvis J.E., Karhohs K.W., Mock C., Batchelor E., Loewer A., Lahav G. p53 dynamics control cell fate // Science. 2012. V. 336, № 6087. P. 1440-1444. [3] Сенотрусова С.Д., Воропаева О.Ф. Математическое моделирование функционирования положи-тельной связи в системе онкомаркеров р53–микроРНК // Сиб. журн. вычисл. математики. 2019. Т. 22, № 3. С. 317-334. [4] Sun T., Cui J. A plausible model for bimodal p53 switch in DNA damage response // FEBS Letters. 2014. V. 588. P. 815-821. [5] Zhang T., Brazhnik P., Tyson J.J. Exploring mechanisms of the DNA-damage response: p53 pulses and their possible relevance to apoptosis // Cell Cycle. 2007. V. 6, № 1. P. 85-94. [6] Воропаева О. Ф., Гаврилова К. С., Сенотрусова С. Д. Минимальные математические модели функционирования белковой сети p53–Mdm2–Wip1–p21 // Сборник трудов Международной научной конференции «Актуальные проблемы прикладной математики, информатики и механики». Воронеж: Издательство «Научно-исследовательские публикации», 2019. С. 672-679. Воропаева О. Ф., Гаврилова К. С., Сенотрусова С. Д. Математическое моделирование функционирования системы биомаркеров дегенеративных заболеваний // Марчуковские научные чтения – 2019: Тезисы Международной конференции «Актуальные проблемы вычислительной и приклад-ной математики». ИВМиМГ СО РАН. Новосибирск, 1–5 июля 2019 г. – Новосибирск: ИПЦ НГУ, 2019. С. 150.