Инд. авторы: | Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А. |
Заглавие: | Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения |
Библ. ссылка: | Николаев С.В., Колчанов Н.А., Голушко С.К., Палаки Ж.-., Урбан О., Амелина Е.В., Юрченко А.В., Голушко К.С., Зубаирова У.С., Пененко А.В., Трубюй А. Моделирование морфодинамики на ранних стадиях эмбриогенеза растения // Вавиловский журнал генетики и селекции. - 2012. - Т.16. - № 4-1. - С.805-815. - ISSN 2500-0462. - EISSN 2500-3259. |
Внешние системы: | РИНЦ: 18266775; |
Реферат: | eng: Embryo morphodynamics at early developmental stages ofArabidopsis thaliana was studied. First, a pipeline was elaborated from confocal microscopy and tissue 3D reconstruction to cell lineage tree reconstruction and numerical simulation of growing embryo mechanics. Tentative results of its use are presented.
|
Ключевые слова: | modeling; finite element method; Developmental biology; embryogenesis; morphodynamics; morphogenesis; Plant embryo; Confocal microscopy; Image analysis; cell lineage; Cell mechanics; |
Издано: | 2012 |
Физ. характеристика: | с.805-815 |
Цитирование: | 1. Болотин В.В., Новичков Ю.Н. Механика многослойных конструкций. М.: Машиностроение, 1980.
2. Голушко С.К., Немировский Ю.В. Прямые и обратные задачи механики упругих композитных пластин и оболочек вращения. М.: Физматлит, 2008.
3. Гонсалес Р., Вудс Р. Цифровая обработка изображений. М.: Техносфера, 2006.
4. Препарата Ф., Шеймос М. Вычислительная геометрия: Введение. М.: Мир, 1989.
5. Bao Z., Murray J.I., Boyle T. et al. Automated cell lineage tracing in Caenorhabditis elegans // Proc. Natl Acad. Sci. USA. 2006. V. 103. P. 2707-2712.
6. Buckingham M.E., Meilhac S.M. Tracing cells for tracking cell lineage and clonal behavior // Developm. Cell. 2011. V. 21. P. 394-409.
7. Chanliaud E., Burrows K.M., Jeronimidis G., Gidley M.J. Mechanical properties of primary plant cell wall analogues // Planta. 2002 V. 215. P. 989-996.
8. Fayant P., Girlanda O., Chebli Y. et al. Finite element model of polar growth in pollen tubes // Plant Cell. 2010. V. 22. P. 2579-2593.
9. Fernandez R., Das P., Mirabet V. et al. Imaging plant growth in 4D: robust tissue reconstruction and lineaging at cell resolution // Nat. Meth. 2010. 7. P. 547-553.
10. Handbook of Biological Confocal Microscopy / Ed. J.B. Pawley. Springer, N.Y. 2nd ed. 2006. 988 p.
11. Kretzschmar K., Watt F.M. Lineage Tracing // Cell. 2012. 148. P. 33-45.
12. Laux T., Würschum T., Breuninger H. Genetic regulation of embryonic pattern formation // Plant Cell. 2004. V. 16. Suppl. 1. P. S190-S202.
13. Olivier N., Luengo-Oroz M.A., Duloquin L. et al. Cell lineage reconstruction of early zebrafish embryos using label-free nonlinear microscopy // Science. 2010. V. 329. P. 967-971.
14. Truernit E., Bauby H., Dubreucq B. et al. High-resolution whole-mount imaging of three-dimensional tissue organization and gene expression enables the study of phloem development and structure in Arabidopsis // Plant Cell. 2008. V. 20. P. 1494-1503.
|